Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms