Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms