Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYT17Q9BSW7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYT17Q9BSW7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms