Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PAAF1Q9BRP4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms