Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms