Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms