Protein–RNA interactions for Protein: Q99929

ASCL2, Achaete-scute homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL2Q99929 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL2Q99929 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL2Q99929 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL2Q99929 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL2Q99929 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL2Q99929 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL2Q99929 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL2Q99929 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL2Q99929 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL2Q99929 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL2Q99929 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL2Q99929 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL2Q99929 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL2Q99929 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL2Q99929 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL2Q99929 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL2Q99929 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL2Q99929 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL2Q99929 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL2Q99929 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL2Q99929 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL2Q99929 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL2Q99929 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL2Q99929 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL2Q99929 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASCL2Q99929 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASCL2Q99929 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASCL2Q99929 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASCL2Q99929 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASCL2Q99929 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL2Q99929 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms