Protein–RNA interactions for Protein: Q99758

ABCA3, ATP-binding cassette sub-family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA3Q99758 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms