Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGRRF1Q99675 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms