Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms