Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP4Q99569 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKP4Q99569 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKP4Q99569 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKP4Q99569 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKP4Q99569 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP4Q99569 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP4Q99569 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP4Q99569 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP4Q99569 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP4Q99569 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP4Q99569 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP4Q99569 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP4Q99569 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP4Q99569 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP4Q99569 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP4Q99569 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP4Q99569 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP4Q99569 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP4Q99569 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms