Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LGMNQ99538 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LGMNQ99538 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LGMNQ99538 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LGMNQ99538 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms