Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD1Q99460 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms