Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NUDCD1Q96RS6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms