Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.41
LMTK3Q96Q04 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms