Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
JSRP1Q96MG2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms