Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms