Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C2orf48Q96LS8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms