Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms