Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALPK3Q96L96 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms