Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms