Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC41A2Q96JW4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC41A2Q96JW4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC41A2Q96JW4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC41A2Q96JW4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC41A2Q96JW4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC41A2Q96JW4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms