Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms