Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP3Q96JB5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms