Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF2Q96GP6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF2Q96GP6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF2Q96GP6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF2Q96GP6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF2Q96GP6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF2Q96GP6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF2Q96GP6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF2Q96GP6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF2Q96GP6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF2Q96GP6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF2Q96GP6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF2Q96GP6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF2Q96GP6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF2Q96GP6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF2Q96GP6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF2Q96GP6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF2Q96GP6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARF2Q96GP6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms