Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CYFIP2Q96F07 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP2Q96F07 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms