Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF0

MTMR8, Myotubularin-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR8Q96EF0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR8Q96EF0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR8Q96EF0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR8Q96EF0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR8Q96EF0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR8Q96EF0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR8Q96EF0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms