Protein–RNA interactions for Protein: Q96E40

SPACA9, Sperm acrosome-associated protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA9Q96E40 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPACA9Q96E40 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPACA9Q96E40 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPACA9Q96E40 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPACA9Q96E40 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPACA9Q96E40 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SPACA9Q96E40 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPACA9Q96E40 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPACA9Q96E40 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPACA9Q96E40 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPACA9Q96E40 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPACA9Q96E40 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPACA9Q96E40 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPACA9Q96E40 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPACA9Q96E40 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPACA9Q96E40 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPACA9Q96E40 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPACA9Q96E40 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPACA9Q96E40 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPACA9Q96E40 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPACA9Q96E40 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPACA9Q96E40 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPACA9Q96E40 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPACA9Q96E40 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPACA9Q96E40 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPACA9Q96E40 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPACA9Q96E40 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPACA9Q96E40 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPACA9Q96E40 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SPACA9Q96E40 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPACA9Q96E40 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPACA9Q96E40 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms