Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSR2Q969E8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms