Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDAQ92838 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDAQ92838 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDAQ92838 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDAQ92838 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDAQ92838 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDAQ92838 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDAQ92838 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDAQ92838 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDAQ92838 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDAQ92838 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDAQ92838 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDAQ92838 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDAQ92838 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDAQ92838 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDAQ92838 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDAQ92838 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDAQ92838 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDAQ92838 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDAQ92838 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDAQ92838 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDAQ92838 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDAQ92838 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDAQ92838 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDAQ92838 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDAQ92838 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDAQ92838 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDAQ92838 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDAQ92838 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EDAQ92838 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EDAQ92838 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EDAQ92838 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EDAQ92838 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EDAQ92838 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EDAQ92838 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EDAQ92838 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EDAQ92838 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EDAQ92838 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EDAQ92838 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EDAQ92838 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EDAQ92838 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EDAQ92838 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EDAQ92838 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EDAQ92838 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EDAQ92838 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EDAQ92838 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EDAQ92838 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EDAQ92838 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EDAQ92838 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EDAQ92838 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EDAQ92838 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EDAQ92838 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
EDAQ92838 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EDAQ92838 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EDAQ92838 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EDAQ92838 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EDAQ92838 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EDAQ92838 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EDAQ92838 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EDAQ92838 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDAQ92838 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDAQ92838 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDAQ92838 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDAQ92838 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDAQ92838 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDAQ92838 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EDAQ92838 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDAQ92838 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDAQ92838 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDAQ92838 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDAQ92838 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDAQ92838 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDAQ92838 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDAQ92838 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDAQ92838 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDAQ92838 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDAQ92838 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDAQ92838 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDAQ92838 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDAQ92838 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDAQ92838 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDAQ92838 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDAQ92838 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDAQ92838 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDAQ92838 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDAQ92838 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDAQ92838 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDAQ92838 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDAQ92838 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDAQ92838 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDAQ92838 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDAQ92838 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDAQ92838 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDAQ92838 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDAQ92838 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDAQ92838 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDAQ92838 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDAQ92838 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDAQ92838 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDAQ92838 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms