Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CSRNP3Q8WYN3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms