Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC12Q8WUD4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms