Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms