Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHW6

OTOS, Otospiralin, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOSQ8NHW6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTOSQ8NHW6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
OTOSQ8NHW6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
OTOSQ8NHW6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTOSQ8NHW6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTOSQ8NHW6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTOSQ8NHW6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTOSQ8NHW6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTOSQ8NHW6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTOSQ8NHW6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTOSQ8NHW6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTOSQ8NHW6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTOSQ8NHW6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTOSQ8NHW6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTOSQ8NHW6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTOSQ8NHW6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
OTOSQ8NHW6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTOSQ8NHW6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTOSQ8NHW6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTOSQ8NHW6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTOSQ8NHW6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTOSQ8NHW6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTOSQ8NHW6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTOSQ8NHW6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms