Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms