Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms