Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms