Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms