Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDPRQ8NCN5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDPRQ8NCN5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDPRQ8NCN5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDPRQ8NCN5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDPRQ8NCN5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDPRQ8NCN5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDPRQ8NCN5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDPRQ8NCN5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDPRQ8NCN5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDPRQ8NCN5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms