Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms