Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms