Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLGALT1Q8NBJ5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms