Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms