Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME8Q8N427 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms