Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HERC6Q8IVU3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC6Q8IVU3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms