Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y13

DZIP3, E3 ubiquitin-protein ligase DZIP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DZIP3Q86Y13 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DZIP3Q86Y13 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DZIP3Q86Y13 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms