Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms