Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms