Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE3BQ7Z3V4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms