Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
STRCQ7RTU9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms